由于渔业有不可推卸的生态系统的影响，寻找促进渔业最充分的贡献可能发展和粮食安全之间的平衡的任务 - 没有不可持续扰乱海洋生态系统 - 可能是对可持续发展的最困难的挑战之一。的历史缺乏有效的印尼综合沿海和海洋管理导致了对资源有限，环境恶化，过度捕捞和贫困小规模渔民的竞争。

根据印尼政府于1999年重组，海洋事务和渔业部（MMAF）成立，以帮助转移重点转向通过渔业部门的沿海社区的经济能力计划和权力下放改善渔民的生活质量。在总共US $ 168万美元的预算用于2003年，85％将下放到区和省级政府。这US $ 42亿美元（25％）被指定用于创收活动和基础设施的发展。MMAF负责鼓励中小规模的企业，包括水产养殖和债务通过提供资金（主要是周转资金），市场和技术，执法的突破和促进以社区为基础的资源管理。

增长的人口压力，在亚洲金融危机和传统农民渔民使用破坏性越来越开放的方式接入资源的竞争，导致整个印尼群岛沿海资源，特别是珊瑚礁和鱼类资源急剧减少。

印尼拥有高达86000公里²珊瑚礁，东南亚的50％以上，并占世界总量的14-18％。它的经济价值估计为US $ 1.6十亿/年，与美国$ 14十亿净现值。超过印度尼西亚珊瑚礁的一半是由破坏性捕鱼做法，包括过度捕捞，爆破和氰化物捕鱼，近海拖网捕鱼，珊瑚开采和细网网的威胁。总之，破坏性的捕捞作业导致在未来20年的净经济损失的美国印尼$ 170万元/年（主要是由于沿海保护，旅游业和渔业）的潜力。

爆炸或炸药捕鱼自1940年以来作为捕捉食用鱼的快速简便的方法已被使用。它占3.75米损失²每100米²每年印尼的珊瑚礁。在未来的20年来，由于爆炸捕鱼的净经济损失印尼已经估计超过美国的5.7亿$。控制的可能性包括防水保险丝禁令，立法任期到当地社区，渔民的教育，立法执法，经济能力打破债务和促进替代生计。

自20世纪80年代以来，人们就开始使用氰化物捕鱼来捕获高价值的珊瑚礁鱼，用于食品和水族馆的活鱼贸易。氰化物的使用导致了珊瑚和相关的礁栖生物的死亡，并导致了在印度尼西亚和其他地方对高价值的礁鱼的过度捕捞。据估计，在今后20年中，氰化物捕鱼给印度尼西亚造成的经济损失超过9.2亿美元。以氰化物为基础的活礁食用鱼贸易是破坏性和不可持续的，需要单独立法和管理。各方的关键优先事项包括教育,建立配额和限制,必须报告的捕捉和数据管理,严格控制使用氰化物,eco-certification水产养殖和氰铅锌鱼,建立海洋保护区和季节性或区域禁止使用引用监控和强制执行立法的框架。

苏拉威西岛拥有印尼最大的珊瑚礁区，在全球海洋生物多样性的中心，而是以破坏性的捕鱼做法最受威胁的东南亚地区之一。沿海各管理项目最近已经或正在开展苏拉威西与变化，但偶尔跟雷竞技令人鼓舞的，结果。南苏拉威西在2001年发展的大海洋渔业生产306000吨，价值US $ 133亿行业雇用（2001年从2000年的47000高达60000）不断增长的渔民人数，但减少平均规模，缺乏高端的价值的物种表明，严重的过度捕捞发生。

传统的印度尼西亚渔民在澳大利亚西北部的MOU Box区域捕鱼存在一些特殊的问题。现在需要的是澳大利亚和印度尼西亚政府与当地渔民之间的协调努力，为参与者提供教育、经济授权和发展替代生计(包括但不限于水产养殖)。两国政府已经同意了这一点，但必须立即采取行动，因为谅解备忘录范围内的资源减少已经迫使渔民采取更具破坏性和/或非法的做法，或完全停止捕鱼活动。

水产养殖已被印尼政府优先考虑，以帮助经济增长，增加出口(虾、石斑鱼和海藻)，并为其人民提供食物(罗非鱼和乳鱼)。南苏拉威西岛有许多机构来发展水产养殖，但它们之间很少合作，甚至竞争。即便如此，虾的半咸水养殖(中国对虾学名:），虱目鱼和海藻在2001年率领生产112000吨，价值US $ 169亿产业从87000公顷。

任何计划作为沿海社区替代生计的水产养殖活动都必须置于以社区为基础的综合沿海管理计划的范围内。这必须包括对地方社区的充分讨论、教育、授权和支持，必须赋予他们拥有、管理和控制自己的资源的权利，以便他们能够可持续地保护和利用这些资源。

石斑鱼文化由于Gondol研究所海水养殖（GRIM）在巴厘岛的成功迅速在印尼成长，允许孵化场养殖石斑鱼鱼苗到对种植业的供应。这个行业现在可能产生高达3000吨，价值高达2000万$，虽然真实的数据是稀缺的。在南苏拉威西，规模依然很小（

石斑鱼文化具有潜在的高盈利能力，有些成熟的技术，在野生种和市场规模的鱼类，因此替代生计和环境效益的需求减少的好处。不过，也有许多制约其适合作为渔民差的替代生计。这些措施包括高科技，石斑鱼养殖的资本密集型和长期回报的特点，打破债务和说服渔民以改变职业，缺乏资源，成熟和幼体培育的难度和季节性的tenureship的，短缺的困难合适的地点和杂鱼，在野生种限制电流生计需求的减少依赖，并限制目前的市场，这是由贸易商和批发商导致利润分配不公的控制上。

促进印尼石斑鱼文化需要采取的措施包括培养技术（包括青少年和成人的池塘养殖），养殖品种，沿海社区的经济和教育的权力，与疾病控制和营养援助的多样化的海岸带综合管理政策，研究和开发要求，以及营销和种子市场规格的鱼战略，拓宽培养石斑鱼需求的发展。

目前对虾养殖是在整个印度尼西亚的下降。为了维护这个行业，如果目前涉及的行业在南苏拉威西的10万人不能被添加到那些寻求替代生计更多的研究（尤其是进入疾病预防）和支持是必需的。

虱目鱼文化，在这两个孵化和成长阶段提供了潜在的生计在南苏拉威西沿海渔民。虱目鱼和虾（也可能是罗非鱼）混养有助于为当地人民的粮食和就业机会。援助是必需的改进旨在提高遮目鱼养殖的经济效益饲养技术。

海藻养殖是南苏拉威西岛和印度尼西亚的一个新兴产业。它有潜力为许多贫穷的渔民，特别是妇女提供可持续的生计，并得到了政府通过印度尼西亚海藻协会的承认和促进。虽然目前不是特别有利可图，但加工和销售方面的进一步发展应会产生更大和更有利可图的文化，并在未来占领工业。

其它基于水产养殖替代生计的可能性包括鲈鱼，龙虾，巨蛤等贝类，罗非鱼，Siganids和珊瑚礁生物的水族馆贸易。大多数的这些和其他一些鱼类已经受到关注，但还没有在南苏拉威西得到充分的发挥。

氰化物通常用来捕捉海洋生物为US $ 200万台水族贸易。该海洋水族馆委员会（MAC），与各种非政府组织一起，促进印尼努力引进非破坏性的捕鱼方法，引进标准和生态核证该生物。这种方案提供了潜在的生计渔民目前正在使用这种贸易在南苏拉威西不可持续的捕获方法。

在科莫多岛和菲律宾的示范项目中，已经使用了鱼类聚集装置(FADs)来吸引洄游的远洋鱼类物种和增加当地的捕鱼量。跟雷竞技南苏拉威西岛的渔民拥有必要的技能，可以鼓励他们采用这些设备来提供就业、高收入，并减少破坏性的捕鱼行为。

社区管理的海洋保护区（海洋保护区）的沿海管理计划内的机构（最好包括石斑鱼产卵的聚合，源珊瑚礁和苗圃区）必须保护当地渔业资源和生计，促进旅游和维持生物多样性的能力。管理应委托当地社区，而是通过政府的支持，因为在6200000公顷现有印尼海洋保护区的，其中只有不到3％，目前评为进行有效的管理。

环境可持续的旅游业，这是能够维持海洋生态系统的功能，提出了替代生计产生日益重要的机会。这是特别真实与有限的自然资源领域。它必须有良好的管理，但是，整体海岸管理计划，以满足其潜在的内部集成。